chr2 99994402 99994426 AFF3_cass_L_f 1 - 0 0 0,0,0 1 24 0 chr2 99991781 99991804 AFF3_cass_L_r 1 + 0 0 0,0,0 1 23 0 chr5 112228300 112228322 APC_cass_L_5_f 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr5 112255228 112255249 APC_cass_S_1_r 1 - 0 0 0,0,0 1 21 0 chr21 26294217 26294239 ffpe_APP_cass_L_f 1 - 0 0 0,0,0 1 22 0 chr21 26291546 26291570 APP_cassette_L_r 1 + 0 0 0,0,0 1 24 0 chr16 281192 281213 AXIN1_cass_L_f 1 - 0 0 0,0,0 1 21 0 chr16 279542 279563 AXIN1_cass_SL_r 1 + 0 0 0,0,0 1 21 0 chr20 52007379 52007401 BCAS1_cass_L_f 1 - 0 0 0,0,0 1 22 0 chr20 52003576 52003598 BCAS1_cass_S_7_r 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr7 16884703 16884726 BCMP11_cass_L_f 1 - 0 0 0,0,0 1 23 0 chr7 16879966 16879990 BCMP11_cass_L_r 1 + 0 0 0,0,0 1 24 0 chr14 53493243 53493261 BMP4_alt5_L_3_f 1 - 0 0 0,0,0 1 18 0 chr14 53493162 53493182 BMP4_alt5_L_1_r 1 + 0 0 0,0,0 1 20 0 chr4 75900119 75900139 BTC_cass_L_2_f 1 - 0 0 0,0,0 1 20 0 chr4 75894922 75894944 BTC_cass_L_1_r 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr11 8889737 8889757 C11orf17_cass_L_1_f 1 + 0 0 0,0,0 1 20 0 chr11 8890589 8890612 C11orf17_cassette_L_r 1 - 0 0 0,0,0 1 23 0 chr15 42460416 42460438 CASC4_cass_S_f 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr15 42482394 42482416 CASC4_cass_L_r 1 - 0 0 0,0,0 1 22 0 chr17 31455437 31455460 CCL4_cass_L_1_f 1 + 0 0 0,0,0 1 23 0 chr17 31456050 31456072 CCL4_cass_L_r 1 - 0 0 0,0,0 1 22 0 chr19 35004820 35004842 CCNE1_cass_L_1_f 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr19 35004987 35005009 CCNE1_cass_L_1_r 1 - 0 0 0,0,0 1 22 0 chr20 44180377 44180398 CD40_alt3_S_2_f 1 + 0 0 0,0,0 1 21 0 chr20 44183774 44183795 CD40_alt3_L_1_r 1 - 0 0 0,0,0 1 21 0 chr6 30970401 30970421 DDR1_cass_L_f 1 + 0 0 0,0,0 1 20 0 chr6 30971189 30971209 DDR1_cass_L_r 1 - 0 0 0,0,0 1 20 0 chr17 40171313 40174246 DRF1_alt3_L_3_f 1 + 0 0 0,0,0 2 5,17 0,2916 chr17 40174298 40174318 DRF1.R2 1 - 0 0 0,0,0 1 20 0 chr18 26828444 26830763 DSC3_cass_L_6_f 1 - 0 0 0,0,0 2 16,9 0,2310 chr18 26828297 26828319 DSC3_cass_L_1_r 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr16 88352512 88352534 FANCA_cass_L_f 1 - 0 0 0,0,0 1 22 0 chr16 88346080 88346101 FANCA_cass_L_2_r 1 + 0 0 0,0,0 1 21 0 chr10 123314995 123315016 FGFR2_cass_L_f 1 - 0 0 0,0,0 1 21 0 chr10 123314060 123314082 FGFR2_cass_L_r 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr2 215945302 215945324 FN1_alt3_L_1_f 1 - 0 0 0,0,0 1 22 0 chr2 215945243 215945265 FN1_alt3_L_r 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr2 215953815 215953835 FN1_cass_L_2_f 1 - 0 0 0,0,0 1 20 0 chr2 215952255 215952277 FN1_cass_L_4_r 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr2 215967497 215967523 FN1_cass_L_1_f 1 - 0 0 0,0,0 1 26 0 chr2 215966113 215966135 FN1_cassette_L_1_r 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr2 215945078 215945099 FN1_intron_L_1_f 1 - 0 0 0,0,0 1 21 0 chr2 215945011 215945032 FN1_intron_L_2_r 1 + 0 0 0,0,0 1 21 0 chr10 8146059 8146081 GATA3_cass_L_f 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr10 8151470 8151490 GATA3_cass_L_r 1 - 0 0 0,0,0 1 20 0 chr12 6820721 6820741 GNB3_intron_L_2_f 1 + 0 0 0,0,0 1 20 0 chr12 6820798 6820820 GNB3_intron_L_3_r 1 - 0 0 0,0,0 1 22 0 chr19 7101530 7103745 INSR_cassette_L_f 1 - 0 0 0,0,0 2 13,9 0,2206 chr19 7094061 7094082 INSR_cass_L_r 1 + 0 0 0,0,0 1 21 0 chr12 87433465 87433485 KITLG_cass_L_f 1 - 0 0 0,0,0 1 20 0 chr12 87425018 87425040 KITLG_cass_L_1_r 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr17 30331702 30331724 LIG3_alt3_L_1_f 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr17 30334157 30334179 LIG3_alt3_L_r 1 - 0 0 0,0,0 1 22 0 chr13 107665840 107665861 LIG4_cass_L_2_f 1 - 0 0 0,0,0 1 21 0 chr13 107664896 107664918 LIG4_cass_L_1_r 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr1 148817362 148817383 MCL1_cass_L_f 1 - 0 0 0,0,0 1 21 0 chr1 148816534 148816556 MCL1_cass_L_r 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr8 32719752 32719772 NRG1_cass_L_f 1 + 0 0 0,0,0 1 20 0 chr8 32726628 32731439 NRG1_cass_L_r 1 - 0 0 0,0,0 2 16,8 0,4803 chr7 154370554 154370574 PAXIP1_alt5_L_f 1 - 0 0 0,0,0 1 20 0 chr7 154370489 154370511 PAXIP1_alt5_L_r 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr15 99789048 99789069 PCSK6_cass_L_2_f 1 - 0 0 0,0,0 1 21 0 chr15 99787724 99787746 PCSK6_cass_S_7_r 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr3 172887181 172887203 PLD1_cass_L_1_f 1 - 0 0 0,0,0 1 22 0 chr3 172878121 172878141 ffpe_PLD1_cass_SL_r 1 + 0 0 0,0,0 1 20 0 chr4 87891266 87891287 PTPN13_cass_L_1_f 1 + 0 0 0,0,0 1 21 0 chr4 87893205 87893229 PTPN13_cassette_L_r 1 - 0 0 0,0,0 1 24 0 chr12 69261086 69261108 PTPRB_cass_L_1_f 1 - 0 0 0,0,0 1 22 0 chr12 69256647 69256669 PTPRB_cass_L_r 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr6 45588090 45588110 RUNX2_cass_L_3_f 1 + 0 0 0,0,0 1 20 0 chr6 45620972 45620996 RUNX2_cass_L_2_r 1 - 0 0 0,0,0 1 24 0 chr1 153207635 153207657 SHC1_cass_S_1_f 1 - 0 0 0,0,0 1 22 0 chr1 153207333 153207354 SHC1_cass_L_1_r 1 + 0 0 0,0,0 1 21 0 chr17 18184116 18184136 SHMT1_cass_L_f 1 - 0 0 0,0,0 1 20 0 chr17 18179685 18179707 SHMT1_cassette_L_r 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr11 4061246 4061268 STIM1_cass_S_1_f 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr11 4062490 4062510 STIM1_rx_L_r 1 - 0 0 0,0,0 1 20 0 chr9 92669281 92669301 SYK_cass_L_f 1 + 0 0 0,0,0 1 20 0 chr9 92676353 92676375 SYK_cass_SL_r 1 - 0 0 0,0,0 1 22 0 chr14 63750894 63750915 ffpe_SYNE2_cass_L_2_f 1 + 0 0 0,0,0 1 21 0 chr14 63751761 63751785 SYNE2_rx_L_r 1 - 0 0 0,0,0 1 24 0 chr2 171647556 171647581 TLK1_cass_L_f 1 - 0 0 0,0,0 1 25 0 chr2 171646424 171646446 TLK1_cass_L_r 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr3 134854917 134854939 TOPBP1_alt3_L_f 1 - 0 0 0,0,0 1 22 0 chr3 134854139 134854163 TOPBP1_alt3_L_r 1 + 0 0 0,0,0 1 24 0 chr11 2380242 2380422 TSSC4_intron_L_2_f 1 + 0 0 0,0,0 2 14,6 0,174 chr11 2380482 2380502 TSSC4_intron_L_1_r 1 - 0 0 0,0,0 1 20 0 chr6 145190187 145190209 UTRN_cass_L_f 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr6 145190489 145191624 UTRN_cass_S_6_r 1 - 0 0 0,0,0 2 16,6 0,1129 chr9 2640493 2640514 VLDLR_cass_L_f 1 + 0 0 0,0,0 1 21 0 chr9 2641459 2641486 VLDLR_cass_L_1_r 1 - 0 0 0,0,0 1 27 0 chr12 121401630 121403236 RSN_cass_L_1_f 1 - 0 0 0,0,0 2 13,11 0,1595 chr12 121397937 121397958 RSN_cass_L_1_r 1 + 0 0 0,0,0 1 21 0 chr12 121397935 121397957 RSN_cass_S_1_r 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr2 100087330 100087353 ffpe_AFF3_cass_S_f 1 - 0 0 0,0,0 1 23 0 chr2 99991801 100087297 AFF3_cass_S_3_r 1 + 0 0 0,0,0 2 25,2 0,95494 chr21 26276658 26294215 APP_cass_S_f 1 - 0 0 0,0,0 2 3,15 0,17542 chr21 26276588 26276612 ffpe_APP_cass_S_r 1 + 0 0 0,0,0 1 24 0 chr16 279605 283505 AXIN1_cass_S_f 1 - 0 0 0,0,0 2 3,17 0,3883 chr16 279543 279563 AXIN1_cass_S_r 1 + 0 0 0,0,0 1 20 0 chr20 52003636 52016870 BCAS1_cass_S_6_f 1 - 0 0 0,0,0 2 5,19 0,13215 chr7 16879990 16888109 BCMP11_cass_S_1_f 1 - 0 0 0,0,0 2 2,17 0,8102 chr7 16879934 16879963 BCMP11_cass_S_r 1 + 0 0 0,0,0 1 29 0 chr4 75900149 75900169 BTC_rx_L_f 1 - 0 0 0,0,0 1 20 0 chr4 75892365 75900094 BTC_cass_S_4_r 1 + 0 0 0,0,0 2 18,2 0,7727 chr15 42460385 42460410 CASC4_cass_S_3_f 1 + 0 0 0,0,0 1 25 0 chr15 42460460 42492844 CASC4_cassette_S_r 1 - 0 0 0,0,0 2 6,19 0,32365 chr17 31455420 31455440 CCL4_cass_S_3_f 1 + 0 0 0,0,0 1 20 0 chr17 31455485 31456754 CCL4_cass_S_2_r 1 - 0 0 0,0,0 2 2,24 0,1245 chr19 35004539 35004990 CCNE1_cassette_S_f 1 + 0 0 0,0,0 2 25,4 0,447 chr19 35005032 35005054 CCNE1_cass_S_1_r 1 - 0 0 0,0,0 1 22 0 chr20 44180384 44180404 CD40_alt3_S_1_f 1 + 0 0 0,0,0 1 20 0 chr20 44180438 44183884 CD40_alt3_S_2_r 1 - 0 0 0,0,0 2 2,19 0,3427 chr6 30970350 30970368 DDR1_cass_S_f 1 + 0 0 0,0,0 1 18 0 chr6 30970425 30972397 DDR1_cass_S_r 1 - 0 0 0,0,0 2 2,21 0,1951 chr17 40171293 40174296 DRF1_alt3_S_2_f 1 + 0 0 0,0,0 2 25,2 0,3001 chr17 40174328 40179980 DRF1_alt3_S_r 1 - 0 0 0,0,0 2 18,4 0,5648 chr18 26828330 26830770 DSC3_cassette_S_f 1 - 0 0 0,0,0 2 6,16 0,2424 chr18 26828282 26828307 DSC3_cass_S_5_r 1 + 0 0 0,0,0 1 25 0 chr22 49316904 49316924 ECGF1_intron_S_1_f 1 - 0 0 0,0,0 1 20 0 chr22 49316576 49316869 ECGF1_intron_S_3_r 1 + 0 0 0,0,0 2 14,5 0,288 chr16 88346129 88355880 FANCA_cass_S_3_f 1 - 0 0 0,0,0 2 2,23 0,9728 chr16 88346070 88346090 FANCA_cass_S_r 1 + 0 0 0,0,0 1 20 0 chr10 123343263 123343284 FGFR2_cass_S_1_f 1 - 0 0 0,0,0 1 21 0 chr10 123314065 123343216 FGFR2_cassette_S_r 1 + 0 0 0,0,0 2 18,4 0,29147 chr2 215945266 215946313 FN1_alt3_S_3_f 1 - 0 0 0,0,0 2 2,24 0,1023 chr2 215945194 215945215 FN1_alt3_S_2_r 1 + 0 0 0,0,0 1 21 0 chr2 215967553 215967575 FN1_cass_S_2_f 1 - 0 0 0,0,0 1 22 0 chr2 215964768 215967500 FN1_cassette_S_1_r 1 + 0 0 0,0,0 2 14,5 0,2727 chr2 215945134 215945155 FN1_intron_S_6_f 1 - 0 0 0,0,0 1 21 0 chr2 215944962 215945080 FN1_intron_S_r 1 + 0 0 0,0,0 2 21,4 0,114 chr10 8140795 8151444 GATA3_cass_S_1_f 1 + 0 0 0,0,0 2 15,3 0,10646 chr10 8151504 8151524 GATA3_cass_S_2_r 1 - 0 0 0,0,0 1 20 0 chr12 6820749 6821013 GNB3_intron_S_6_f 1 + 0 0 0,0,0 2 20,3 0,261 chr12 6821045 6822411 GNB3_intron_S_3_r 1 - 0 0 0,0,0 2 4,17 0,1349 chr19 7094096 7103751 INSR_cass_S_2_f 1 - 0 0 0,0,0 2 5,15 0,9640 chr19 7094018 7094038 INSR_cass_S_3_r 1 + 0 0 0,0,0 1 20 0 chr12 87434291 87434314 KITLG_cass_S_1_f 1 - 0 0 0,0,0 1 23 0 chr12 87425026 87434243 KITLG_cass_S_4_r 1 + 0 0 0,0,0 2 19,2 0,9215 chr17 30331696 30331717 LIG3_alt3_S_2_f 1 + 0 0 0,0,0 1 21 0 chr17 30331750 30334378 LIG3_alt3_S_r 1 - 0 0 0,0,0 2 4,15 0,2613 chr13 107661643 107665851 LIG4_cass_S_4_f 1 - 0 0 0,0,0 2 2,19 0,4189 chr13 107661594 107661616 LIG4_cass_S_2_r 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr8 32719736 32719761 NRG1_cass_S_f 1 + 0 0 0,0,0 1 25 0 chr8 32719791 32731449 NRG1_cass_S_1_r 1 - 0 0 0,0,0 2 2,18 0,11640 chr7 154369452 154370565 PAXIP1_alt5_S_3_f 1 - 0 0 0,0,0 2 4,20 0,1093 chr7 154369376 154369398 PAXIP1_alt5_S_1_r 1 + 0 0 0,0,0 1 22 0 chr15 99787785 99789734 PCSK6_cass_S_5_f 1 - 0 0 0,0,0 2 6,17 0,1932 chr3 172878174 172887873 PLD1_cassette_S_f 1 - 0 0 0,0,0 2 4,19 0,9680 chr3 172878124 172878144 ffpe_PLD1_cass_S_r 1 + 0 0 0,0,0 1 20 0 chr8 42315340 42321630 POLB_cass_S_f 1 + 0 0 0,0,0 2 20,3 0,6287 chr8 42321673 42325694 POLB_cass_S_1_r 1 - 0 0 0,0,0 2 21,4 0,4017 chr4 87891278 87898438 PTPN13_cass_S_4_f 1 + 0 0 0,0,0 2 23,2 0,7158 chr4 87898465 87898489 ffpe_PTPN13_cass_SL_r 1 - 0 0 0,0,0 1 24 0 chr12 121397977 121403252 RSN_cass_S_2_f 1 - 0 0 0,0,0 2 2,27 0,5248 chr6 45588047 45588068 RUNX2_cass_S_4_f 1 + 0 0 0,0,0 1 21 0 chr6 45588118 45622558 RUNX2_cass_S_2_r 1 - 0 0 0,0,0 2 4,17 0,34423 chr1 153207129 153207611 SHC1_cass_S_4_f 1 - 0 0 0,0,0 2 2,17 0,465 chr1 153206895 153207101 SHC1_cass_S_5_r 1 + 0 0 0,0,0 2 2,22 0,184 chr11 4061302 4064299 STIM1_cass_S_3_r 1 - 0 0 0,0,0 2 2,17 0,2980 chr9 92667182 92676307 SYK_cass_S_f 1 + 0 0 0,0,0 2 18,1 0,9124 chr2 171647566 171647594 TLK1_cass_S_f 1 - 0 0 0,0,0 1 28 0 chr2 171625892 171647540 TLK1_cass_S_r 1 + 0 0 0,0,0 2 20,4 0,21644 chr3 134854144 134854901 TOPBP1_alt3_S_1_f 1 - 0 0 0,0,0 2 4,23 0,734 chr3 134854101 134854126 TOPBP1_alt3_S_r 1 + 0 0 0,0,0 1 25 0 chr11 2380219 2380240 TSSC4_intron_S_2_f 1 + 0 0 0,0,0 1 21 0 chr11 2380453 2380663 TSSC4_intron_S_5_r 1 - 0 0 0,0,0 2 5,13 0,197 chr9 2640450 2640476 VLDLR_cass_S_f 1 + 0 0 0,0,0 1 26 0 chr9 2640512 2641893 VLDLR_cass_S_r 1 - 0 0 0,0,0 2 4,20 0,1361